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訊息:天津大學創(chuàng)新DNA存儲算法讓千年敦煌壁畫再保存千年萬年

時間:2022-09-17 09:41:31    來源:工人日報客戶端    

原標題:天津大學創(chuàng)新DNA存儲算法讓千年敦煌壁畫再保存千年萬年

工人日報-中工網(wǎng)記者張璽 通訊員趙暉


(資料圖片)

記者日前從天津大學獲悉,該校合成生物學團隊創(chuàng)新DNA存儲算法,將十幅精選敦煌壁畫存入DNA中,通過加速老化實驗驗證,壁畫信息在實驗室常溫下可保存千年,在9.4°C下可保存兩萬年。該算法支持DNA分子成為世界上最可靠的數(shù)據(jù)存儲介質(zhì)之一,可以讓面臨老化破損危機的人類文化遺產(chǎn)信息保存千年萬年。

從結(jié)繩記事、倉頡造字到磁帶、硬盤等現(xiàn)代磁光電存儲技術(shù),人類文明的發(fā)展與存儲技術(shù)密切相關(guān)。隨著科學技術(shù)的進步,數(shù)據(jù)存儲方式不斷迭代創(chuàng)新。中國科學院院士、天津大學元英進教授團隊一直致力于研究下一代存儲技術(shù)——DNA存儲。

圖1 DNA存儲的敦煌壁畫

“據(jù)國際數(shù)據(jù)公司估計,到2025年全球數(shù)據(jù)總量將達到驚人的175 ZB(1 ZB ≈ 1021 字節(jié))。全世界都在建數(shù)據(jù)中心,數(shù)據(jù)中心的能耗是驚人的。DNA存儲由于其高存儲密度與低能耗處理等特點,被視為一種極具潛力的存儲技術(shù),成為應(yīng)對數(shù)據(jù)存儲增長挑戰(zhàn)的新機遇?!霸⑦M院士介紹說。

2021年8月,元英進教授團隊取得DNA存儲的重大突破。該工作及后續(xù)研究內(nèi)容先后發(fā)表于《National Science Review(國家科學評論)》和《SCIENCE CHINA-Life Sciences(中國科學-生命科學)》。

圖2 DNA存儲技術(shù)概念圖

DNA存儲高效低耗,但作為一種鏈式生物大分子,在體外常溫保存時會面臨DNA斷裂降解等風險,嚴重影響信息存儲的長期可靠性,是亟待解決的關(guān)鍵科學問題。對此,元英進團隊設(shè)計了基于德布萊英圖理論的序列重建算法來解決DNA斷裂等問題。該算法結(jié)合貪婪路徑搜索和循環(huán)冗余校驗碼來實現(xiàn)斷裂DNA片段的高效從頭組裝,從原理上支持了DNA存儲的長期可靠性。

圖3 基于德布萊英圖圖論設(shè)計的序列重建算法高效解決DNA斷裂、降解問題

結(jié)合該序列重建算法(內(nèi)碼)與噴泉碼算法(外碼),團隊設(shè)計編碼了6.8 MB敦煌壁畫,合成了承載圖片信息的DNA片段21萬條。為數(shù)據(jù)的長期可靠性,團隊制備了一個沒有任何特殊保護的DNA水溶液樣本,并在70°C下加速樣本斷裂、降解長達十周。處理后的DNA片段80%以上都發(fā)生了斷裂錯誤,依靠設(shè)計的序列重建算法依然可以準確組裝并解碼96.4%以上的片段,再通過噴泉碼解決少量片段丟失的問題,原始的敦煌壁畫圖片依然能夠完美恢復(fù)。根據(jù)理論推算,這種程度的高溫破壞相當于實驗室常溫25°C一千年或者9.4°C長達兩萬年的自然保存。

據(jù)介紹,這是繼基于人工合成染色體的酵母體內(nèi)信息存儲模式取得突破后,天津大學合成生物學團隊在DNA信息體外存儲模式上又取得的重要突破。

標簽: 敦煌壁畫 天津大學 存儲技術(shù)

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